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第四，为生物细菌提供良好的繁殖环境。
菌肥的作用只有在土壤中大量繁殖菌株后才能有效体现。为了尽快培育出菌株，需要为其提供适宜的环境。
1.合适的PH值。一般酸性土壤直接施用菌肥效果较差。例如，硅酸盐细菌需要在PH7-8的土壤中生存，因此石灰和草木灰应该一起使用，以加强微生物的活性。
2.微生物生长需要足够的水分，但水分过多会造成通风不良，影响好氧微生物的活动。因此，必须注意及时灌溉和排水，以保持土壤中的适量水分。
3.生物肥料中的微生物多为好氧微生物，如根瘤菌、固氮菌、磷细菌等。因此，施用菌肥必须结合土壤改良和合理耕作，保持土壤疏松和通风良好。
五、使用生物有机肥必须投放足够的有机肥。
有机物是微生物的主要能量来源，其分解也能供给微生物营养。所以在施用生物肥的时候，有机肥一定要配合使用。因此，菜农应将菌肥与粪肥等有机肥配合使用，既能加快有机肥的分解，又能促进细菌菌群的形成，提供菌肥的肥效。因此，必须供应充足的氮、磷、钾和微量元素。例如，在豆科作物的生长初期，必须供应适量的氮，以促进作物生长和根瘤发育，增加固氮作用；磷肥可以起到“以磷增氮”的作用；适当的钾、钙营养有利于微生物的大量繁殖；钼是根瘤菌合成固氮酶的必需元素，钼肥与根瘤菌肥配合使用可明显提高固氮效率。分享来自新未来生物技术。
六、生物菌不应与氮、磷、钾肥一起使用。
细菌适合与有机质一起使用，但与氮、磷、钾等复合肥一起使用时，会杀死一些微生物细菌，降低肥效。
